rmarkdown.utf8

class: inverse, center

# <svg style="height:0.8em;top:.04em;position:relative;fill:steelblue;" viewBox="0 0 581 512"><path d="M581 226.6C581 119.1 450.9 32 290.5 32S0 119.1 0 226.6C0 322.4 103.3 402 239.4 418.1V480h99.1v-61.5c24.3-2.7 47.6-7.4 69.4-13.9L448 480h112l-67.4-113.7c54.5-35.4 88.4-84.9 88.4-139.7zm-466.8 14.5c0-73.5 98.9-133 220.8-133s211.9 40.7 211.9 133c0 50.1-26.5 85-70.3 106.4-2.4-1.6-4.7-2.9-6.4-3.7-10.2-5.2-27.8-10.5-27.8-10.5s86.6-6.4 86.6-92.7-90.6-87.9-90.6-87.9h-199V361c-74.1-21.5-125.2-67.1-125.2-119.9zm225.1 38.3v-55.6c57.8 0 87.8-6.8 87.8 27.3 0 36.5-38.2 28.3-87.8 28.3zm-.9 72.5H365c10.8 0 18.9 11.7 24 19.2-16.1 1.9-33 2.8-50.6 2.9v-22.1z"/></svg>  para análisis de datos 🚀<br> <br>

## 🎉 Reportes con Rmarkdown 💻<br> <br> <br>

.large[Roxana N. Villafañe | LEMyP | <a href='http://twitter.com/data_datum'><svg style="height:0.8em;top:.04em;position:relative;fill:steelblue;" viewBox="0 0 512 512"><path d="M459.37 151.716c.325 4.548.325 9.097.325 13.645 0 138.72-105.583 298.558-298.558 298.558-59.452 0-114.68-17.219-161.137-47.106 8.447.974 16.568 1.299 25.34 1.299 49.055 0 94.213-16.568 130.274-44.832-46.132-.975-84.792-31.188-98.112-72.772 6.498.974 12.995 1.624 19.818 1.624 9.421 0 18.843-1.3 27.614-3.573-48.081-9.747-84.143-51.98-84.143-102.985v-1.299c13.969 7.797 30.214 12.67 47.431 13.319-28.264-18.843-46.781-51.005-46.781-87.391 0-19.492 5.197-37.36 14.294-52.954 51.655 63.675 129.3 105.258 216.365 109.807-1.624-7.797-2.599-15.918-2.599-24.04 0-57.828 46.782-104.934 104.934-104.934 30.213 0 57.502 12.67 76.67 33.137 23.715-4.548 46.456-13.32 66.599-25.34-7.798 24.366-24.366 44.833-46.132 57.827 21.117-2.273 41.584-8.122 60.426-16.243-14.292 20.791-32.161 39.308-52.628 54.253z"/></svg> @data_datum</a>] <br> 
.large[Florencia D'Andrea | INTA-CONICET | <a href="http://twitter.com/cantoflor_87"> <svg style="height:0.8em;top:.04em;position:relative;fill:steelblue;" viewBox="0 0 512 512"><path d="M459.37 151.716c.325 4.548.325 9.097.325 13.645 0 138.72-105.583 298.558-298.558 298.558-59.452 0-114.68-17.219-161.137-47.106 8.447.974 16.568 1.299 25.34 1.299 49.055 0 94.213-16.568 130.274-44.832-46.132-.975-84.792-31.188-98.112-72.772 6.498.974 12.995 1.624 19.818 1.624 9.421 0 18.843-1.3 27.614-3.573-48.081-9.747-84.143-51.98-84.143-102.985v-1.299c13.969 7.797 30.214 12.67 47.431 13.319-28.264-18.843-46.781-51.005-46.781-87.391 0-19.492 5.197-37.36 14.294-52.954 51.655 63.675 129.3 105.258 216.365 109.807-1.624-7.797-2.599-15.918-2.599-24.04 0-57.828 46.782-104.934 104.934-104.934 30.213 0 57.502 12.67 76.67 33.137 23.715-4.548 46.456-13.32 66.599-25.34-7.798 24.366-24.366 44.833-46.132 57.827 21.117-2.273 41.584-8.122 60.426-16.243-14.292 20.791-32.161 39.308-52.628 54.253z"/></svg> @cantoflor_87</a><br>]

✨
<br> Página web del curso en <https://flor14.github.io/Curso_r_unne_2020/> 🌟

---
class: inverse, center
<img src="img/rmarkdown.png" width="50%" align="center" />

---
<img src="img/rmarkdown_horst.png" width="100%" align="center" />

.footnote[https://github.com/allisonhorst/stats-illustrations]

---
# Flujo de Ciencia de Datos 📌

---

# ✨ RMarkdown

### 🌟Un marco de autoría para ciencia de datos.
### 🌟Un paquete llamado RMarkdown
### 🌟Un documento de formato .Rmd
### 🌟Un formato de archivo para hacer documentos dinámicos con R. 
### 🌟Una herramienta para integrar código, texto, gráficos y resultados.

.footnote[bit.ly/r4med-allison]

---
background-image: url(img/bosque-msg.png)
background-size: cover
class: center, middle

# RMarkdown 
# permite generación de informes, presentaciones, páginas web, tesis, libros, póster, etc.

---
background-image: url(img/libros-msg.png)
background-size: cover
class: center, middle
# 1. METADATA

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Inicio de un archivo .Rmd

---

# Inicio de un archivo .Rmd

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Partes de un archivo .Rmd

---
background-image: url(img/textura-fondo.png)
background-size: cover
class: center, middle, inverse

# 🔧 DEMO 💻

---
class: center, middle

# 💡
## Genere un archivo con extensión .Rmd, elija un nombre, y aprete el botón `knit` con formato de salida: .html
## Inspeccione el archivo generado

---
background-image: url(img/libros2-msg.png)
background-size: cover
class: center, middle
# 2. TEXTO

---

# Títulos

.pull-left[

```r
# Título 1

## Título 2

### Título 3

#### Título 4

##### Título 5

###### Título 6
```

]
--
.pull-right[

# Título 1

## Título 2

### Título 3

#### Título 4

##### Título 5

###### Título 6

]

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Texto

.pull-left[

```r
### Esto es una **negrita**

### Esto es _cursiva_
```

]
--
.pull-right[

### Esto es una **negrita**

### Esto es _cursiva_

]

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Listas 📋

.pull-left[
```
Esto es una lista
- Mañana 
- Tarde
- Noche
Esto es una lista
1. Mañana
1. Tarde
1. Noche
```
]

.pull-right[

Esto es una lista
- Mañana
- Tarde
- Noche

Esto es una lista
1. Mañana
1. Tarde
1. Noche

]

---

# Imágenes 📷

Se puede insertar como código html

.pull-left[

< img src="img/rmarkdown_horst2.png" width="100%" align="center" />

]

.pull-right[

]

---
background-image: url(img/textura-fondo.png)
background-size: cover
class: center, middle, inverse

# 🔧 DEMO 💻

---
class: center, middle

# 💡
## En el archivo generado, modifique los títulos y el texto. 
## Genere una lista de items.
## Inserte una imagen cualquiera.

---

background-image: url(img/libros3-msg.png)
background-size: cover
class: center, middle
# 3. CÓDIGO <svg style="height:0.8em;top:.04em;position:relative;fill:steelblue;" viewBox="0 0 581 512"><path d="M581 226.6C581 119.1 450.9 32 290.5 32S0 119.1 0 226.6C0 322.4 103.3 402 239.4 418.1V480h99.1v-61.5c24.3-2.7 47.6-7.4 69.4-13.9L448 480h112l-67.4-113.7c54.5-35.4 88.4-84.9 88.4-139.7zm-466.8 14.5c0-73.5 98.9-133 220.8-133s211.9 40.7 211.9 133c0 50.1-26.5 85-70.3 106.4-2.4-1.6-4.7-2.9-6.4-3.7-10.2-5.2-27.8-10.5-27.8-10.5s86.6-6.4 86.6-92.7-90.6-87.9-90.6-87.9h-199V361c-74.1-21.5-125.2-67.1-125.2-119.9zm225.1 38.3v-55.6c57.8 0 87.8-6.8 87.8 27.3 0 36.5-38.2 28.3-87.8 28.3zm-.9 72.5H365c10.8 0 18.9 11.7 24 19.2-16.1 1.9-33 2.8-50.6 2.9v-22.1z"/></svg>

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Código <svg style="height:0.8em;top:.04em;position:relative;fill:steelblue;" viewBox="0 0 581 512"><path d="M581 226.6C581 119.1 450.9 32 290.5 32S0 119.1 0 226.6C0 322.4 103.3 402 239.4 418.1V480h99.1v-61.5c24.3-2.7 47.6-7.4 69.4-13.9L448 480h112l-67.4-113.7c54.5-35.4 88.4-84.9 88.4-139.7zm-466.8 14.5c0-73.5 98.9-133 220.8-133s211.9 40.7 211.9 133c0 50.1-26.5 85-70.3 106.4-2.4-1.6-4.7-2.9-6.4-3.7-10.2-5.2-27.8-10.5-27.8-10.5s86.6-6.4 86.6-92.7-90.6-87.9-90.6-87.9h-199V361c-74.1-21.5-125.2-67.1-125.2-119.9zm225.1 38.3v-55.6c57.8 0 87.8-6.8 87.8 27.3 0 36.5-38.2 28.3-87.8 28.3zm-.9 72.5H365c10.8 0 18.9 11.7 24 19.2-16.1 1.9-33 2.8-50.6 2.9v-22.1z"/></svg> (Code chunks)

En un chunk se puede ejecutar código igualmente como se realiza en la consola de R.

```r
library(gapminder)
library(dplyr)
gapminder %>%
  unique()
```

```
## # A tibble: 1,704 x 6
##    country     continent  year lifeExp      pop gdpPercap
##    <fct>       <fct>     <int>   <dbl>    <int>     <dbl>
##  1 Afghanistan Asia       1952    28.8  8425333      779.
##  2 Afghanistan Asia       1957    30.3  9240934      821.
##  3 Afghanistan Asia       1962    32.0 10267083      853.
##  4 Afghanistan Asia       1967    34.0 11537966      836.
##  5 Afghanistan Asia       1972    36.1 13079460      740.
##  6 Afghanistan Asia       1977    38.4 14880372      786.
##  7 Afghanistan Asia       1982    39.9 12881816      978.
##  8 Afghanistan Asia       1987    40.8 13867957      852.
##  9 Afghanistan Asia       1992    41.7 16317921      649.
## 10 Afghanistan Asia       1997    41.8 22227415      635.
## # … with 1,694 more rows
```

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Inline Code

### Es mezclar código de R junto a texto

```r
texto texto texto `r code` texto texto texto 
```

Ejemplo: Dos más dos es 4

```r
#### El valor de 4, surge de ejecutar la suma de `r 2 + 2`
```

---

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Opciones por defecto

```r
str(knitr::opts_chunk$get())
```

```
## List of 53
##  $ eval         : logi TRUE
##  $ echo         : logi TRUE
##  $ results      : chr "markup"
##  $ tidy         : logi FALSE
##  $ tidy.opts    : NULL
##  $ collapse     : logi FALSE
##  $ prompt       : logi FALSE
##  $ comment      : chr "##"
##  $ highlight    : logi TRUE
##  $ strip.white  : logi TRUE
##  $ size         : chr "normalsize"
##  $ background   : chr "#F7F7F7"
##  $ cache        : logi FALSE
##  $ cache.path   : chr "rmarkdown_cache/html/"
##  $ cache.vars   : NULL
##  $ cache.lazy   : logi TRUE
##  $ dependson    : NULL
##  $ autodep      : logi FALSE
##  $ cache.rebuild: logi FALSE
##  $ fig.keep     : chr "high"
##  $ fig.show     : chr "asis"
##  $ fig.align    : chr "default"
##  $ fig.path     : chr "rmarkdown_files/figure-html/"
##  $ dev          : chr "png"
##  $ dev.args     : NULL
##  $ dpi          : num 72
##  $ fig.ext      : NULL
##  $ fig.width    : num 7
##  $ fig.height   : num 7
##  $ fig.env      : chr "figure"
##  $ fig.cap      : NULL
##  $ fig.scap     : NULL
##  $ fig.lp       : chr "fig:"
##  $ fig.subcap   : NULL
##  $ fig.pos      : chr ""
##  $ out.width    : NULL
##  $ out.height   : NULL
##  $ out.extra    : NULL
##  $ fig.retina   : num 1
##  $ external     : logi TRUE
##  $ sanitize     : logi FALSE
##  $ interval     : num 1
##  $ aniopts      : chr "controls,loop"
##  $ warning      : logi TRUE
##  $ error        : logi FALSE
##  $ message      : logi TRUE
##  $ render       : NULL
##  $ ref.label    : NULL
##  $ child        : NULL
##  $ engine       : chr "R"
##  $ split        : logi FALSE
##  $ include      : logi TRUE
##  $ purl         : logi TRUE
```

---

# `echo=FALSE`

## Usamos esta orden para ocultar código, mostrándo sólo el resultado de correr el código

---

# `eval=FALSE`

## Usamos esta orden para que no se ejecute el código. Es útil cuando queremos mostrar código como ejemplo para presentaciones.

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# `warning=FALSE` y `message=FALSE`

## Se utiliza estas órdenes para ocultar los mensajes de precaución y los mensajes que nos tira R.

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# `fig.height=5` y `fig.width=8`

## Se utiliza esta orden para las imagenes que creamos en el chunk de R. Nos permite modificar el largo y ancho.

---

# `fig.align="left"`

## Se utiliza esta orden para alinear las figuras generadas en el chunk de R.

---

background-image: url(img/textura-fondo.png)
background-size: cover
class: center, middle, inverse

# 🔧 DEMO 💻

---

class: center, middle

# 💡
## Ingrese un dataset cualquiera de los que hemos trabajado. 
## Copie el código de algún gráfico generado en estos días (puede ser de cualquier dataset)

---
background-image: url(img/libros4-msg.png)
background-size: cover
class: center, middle

# 4. SALIDAS

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Presentaciones con xaringan

---

# Blogs con Blogdown

.footnote[más información en https://bookdown.org/yihui/blogdown/]
---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Libros con bookdown

.footnote[más información en https://bookdown.org/yihui/bookdown/ y https://es.r4ds.hadley.nz/]
---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# CV con Vitae o Pagedown

.footnote[[*] 
Más información en https://github.com/nstrayer/cv]

---

# Póster con posterdown

.footnote[[*] 
Más información en https://github.com/brentthorne/posterdown]

---

# Tutoriales con learnr

.footnote[más información en
https://rstudio.cloud/learn/primers y 
https://rstudio.github.io/learnr/]

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

#Tesis con thesisdown

.footnote[Mas información en https://github.com/ismayc/thesisdown
Tesis disponible en https://jcrodriguez1989.github.io/tesis_doctoral/]

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# RMarkdown cheatsheet

---
<img src="img/rmarkdown-logo.png" width="10%" align="right" />

# Material de consulta

Otros links de interés:
https://alison.rbind.io/talk/

---

```r
sessionInfo() 
```

```
## R version 3.6.3 (2020-02-29)
## Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
## Running under: Ubuntu 20.04 LTS
## 
## Matrix products: default
## BLAS:   /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.9.0
## LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.9.0
## 
## locale:
##  [1] LC_CTYPE=es_AR.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
##  [3] LC_TIME=es_AR.UTF-8        LC_COLLATE=es_AR.UTF-8    
##  [5] LC_MONETARY=es_AR.UTF-8    LC_MESSAGES=es_AR.UTF-8   
##  [7] LC_PAPER=es_AR.UTF-8       LC_NAME=C                 
##  [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
## [11] LC_MEASUREMENT=es_AR.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
## 
## attached base packages:
## [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
## 
## other attached packages:
## [1] dplyr_0.8.5       gapminder_0.3.0   emo_0.0.0.9000    fontawesome_0.1.0
## 
## loaded via a namespace (and not attached):
##  [1] Rcpp_1.0.4.6     knitr_1.28       magrittr_1.5     tidyselect_1.0.0
##  [5] R6_2.4.1         rlang_0.4.6      fansi_0.4.1      stringr_1.4.0   
##  [9] tools_3.6.3      xfun_0.13        xaringan_0.16    utf8_1.1.4      
## [13] cli_2.0.2        htmltools_0.4.0  ellipsis_0.3.1   yaml_2.2.1      
## [17] assertthat_0.2.1 digest_0.6.25    tibble_3.0.1     lifecycle_0.2.0 
## [21] crayon_1.3.4     purrr_0.3.4      vctrs_0.3.1      glue_1.4.1      
## [25] evaluate_0.14    rmarkdown_2.1    stringi_1.4.6    compiler_3.6.3  
## [29] pillar_1.4.4     generics_0.0.2   lubridate_1.7.8  pkgconfig_2.0.3
```